3.3　本章小结

基于蛋白质在最大表达值附近处于活性状态这一推断，我们提出了3-sigma准则为每个蛋白质计算一个活性阈值来识别其活性时刻点。对于一个蛋白质，如果它在某个时刻的表达值不小于其活性阈值，那么它被认为在该时刻处于活性状态。动态蛋白质网络（APIN）由活性蛋白质和它们之间的相互作用组成。本章详细介绍了APIN的模型及构造方法。为评估网络的性能，以MCL算法为例，在APIN、TC-PIN和SPIN上识别蛋白质复合物。MCL在APIN上预测蛋白质复合物的性能优于SPIN和TC-PIN。这表明，APIN是一个能够更加精确反映蛋白质相互作用动态性的网络。APIN不仅可以预测蛋白质复合物，也可以做其他网络分析，比如通路推断、关键蛋白预测、蛋白质功能预测和疾病诊断与预测等。