第一节 南水北调主体工程投资规模
本节主要介绍南水北调主体工程在前期工作各阶段的投资规模。南水北调工程严格按照基本建设程序，经过总体规划、项目建议书、可行性研究、初步设计等审批环节，前一个环节是后一环节的基础，对项目建设内容的认知程度逐步加深和细化，最终接近工程建设的实际内容，工程量呈不断增加的趋势。同时，工程前期工作各阶段的市场价格和政策等因素都在发生变化，从而使测算的投资规模不断增加。在研究筹资渠道或政策过程中，全面掌握规划阶段、可行性研究阶段和初步设计阶段投资规模，以及引起投资变化的主要因素十分必要。
2002年，国务院批复《南水北调工程总体规划》，按照2000年下半年价格水平，初步匡算南水北调东、中线一期主体工程静态投资为1240亿元。2008年，国务院第32次常务会议，批准了南水北调东、中线一期工程可行性研究总报告，按照2004年第三季度价格水平，估算南水北调东、中线一期工程总投资2546亿元，其中静态投资1818亿元，动态投资502亿元（建设期价差和贷款利息），增加耕地占用税226亿元，与规划阶段1240亿元相比增加了1306亿元。2014年，国务院批复南水北调东、中线一期工程增加投资测算及筹资方案，核定南水北调东、中线一期工程总投资3082亿元，其中静态投资2242亿元，动态投资534亿元，新增项目投资18亿元，特殊预备费20亿元，以及地方负责组织实施的治污工程等项目投资268亿元，与可行性研究阶段2546亿元相比增加了536亿元。
南水北调工程投资，依据《水利水电工程设计概（估）算费用构成及计算标准》（水建〔1998〕15号，工程规划阶段依据）、《水利工程设计概（估）算编制规定》（水利部水总〔2002〕116号，工程可行性研究和初步设计阶段依据）、《工程勘察设计收费标准》（2002年后使用修订本）和国家有关规定，按照南水北调工程方案计算的土石方、混凝土及钢筋混凝土等工程量和工程单价测算。南水北调工程建设征地补偿及移民投资，依据《中华人民共和国土地管理法》《大中型水利水电工程建设征地补偿和移民安置条例》和国家有关规定，按照征地范围内移民人口或影响人口、实物量和征地数量，以及补偿标准和价格测算。
一、南水北调工程总体规划阶段匡算投资
在2002年国务院批复的《南水北调工程总体规划》中，南水北调工程分东、中、西三条线路，分期建设，每年总调水规模448亿m3，静态总投资4860亿元。其中，南水北调东线工程包括一期、二期和三期工程，每年调水规模148亿m3，静态投资650亿元；南水北调中线工程包括一期和二期工程，每年调水规模130亿m3，静态投资1170亿元；南水北调西线工程包括一期、二期和三期工程，每年调水规模170亿m3，静态投资3040亿元。根据我国北方地区缺水的紧迫形势，国务院批准先期实施南水北调东、中线一期工程，每年调水规模184亿m3，静态投资1240亿元。
（一）南水北调东线一期工程规划投资
南水北调工程规划阶段，南水北调东线一期工程多年平均抽江水量89亿m3，静态投资320亿元。南水北调东线一期工程投资由调水工程投资和治污工程投资两部分组成，按照地域又可划分为江苏境内工程投资和山东境内工程投资两部分。
1.南水北调东线一期调水工程规划投资
南水北调东线一期工程是在现有江水北调工程基础上，扩大调水规模并延长输水线路逐级提水北送。南水北调东线一期工程由输水河道、泵站、调蓄湖泊、水库、穿黄工程，以及里下河水源调整、截污导流、供电、调度运行管理等一系列专项工程组成，共需完成土石方21961万m3，混凝土及钢筋混凝土192万m3，砌石262万m3，工程永久占地16万亩。增扩建泵站22座，增加装机容量20.7万kW。
按照2000年下半年价格水平，匡算的南水北调东线一期工程规划阶段静态投资为180亿元（含截污导流工程投资17.25亿元），其中江苏境内工程投资72亿元（含截污导流工程投资6.43亿元），山东境内工程投资108亿元（含截污导流工程投资10.82亿元）。
2.南水北调东线一期治污工程规划投资
为保障南水北调东线工程调水水质，按照“先节水后调水、先治污后通水、先环保后用水”的原则，制定了南水北调东线工程治污规划，并将污染治理按工程实施进度要求划分，南水北调东线一期工程的重点是黄河以南和鲁北地区污染治理。按照治污工程项目性质不同，南水北调东线治污工程划分为城市污水处理厂建设工程、截污导流工程、工业结构调整工程、工业综合治理工程和流域综合整治工程等5类项目。南水北调东线一期截污导流工程22项，投资21.18亿元（纳入调水工程17.25亿元）；新建、扩建城市污水处理厂78座，投资96.68亿元；关停并转污染工业企业38家，投资5.46亿元；实施清洁生产工程、达标再提高工程、企业污水回用工程规划115家，投资6.7亿元；流域综合治理类项目11个，投资9.9亿元。因此，南水北调东线一期治污工程静态投资约为140亿元，其中江苏境内项目50亿元，山东境内项目90亿元。
综上，南水北调东线一期主体工程规划阶段静态投资为320亿元，其中调水工程180亿元，治污工程140亿元。
（二）南水北调中线一期工程规划投资
南水北调工程规划阶段，南水北调中线一期工程多年平均调水量95亿m3，静态投资920亿元。南水北调中线一期工程投资由水源工程规划投资、干线工程规划投资和汉江中下游治理工程规划投资三部分组成。
1.南水北调中线一期水源工程规划投资
南水北调中线一期水源工程是加高完建丹江口水利枢纽，主要包括丹江口大坝加高工程和丹江口水库淹没及移民安置项目。
（1）丹江口大坝加高工程。加高完建丹江口水利枢纽，正常蓄水位由157m提升到170m，相应库容由174.5亿m3增加到290.5亿m3。混凝土坝坝顶高程由162m加高到176.6m，两岸土石坝坝顶高程加高到177.6m，并向两岸延伸至相应高程。垂直升船机由150t提高至300t。主要工程量为：土石方640万m3，混凝土128万m3，钢筋钢材1.3万t，接缝灌浆9438m2，坝区工程永久占地和临时占地3000多亩。按照2000年下半年价格水平，匡算的丹江口大坝加高工程规划阶段静态投资约为22亿元。
（2）丹江口水库淹没及移民安置。因丹江口水库大坝加高，2000年水库主要淹没实物量，移民迁移线下人口24.95万人（推算至2010年的人口约为30万人），房屋708.57万m2，耕园地23.5万亩，5个城镇及工业企业106家，等级公路308km，高压输电线路288km，通讯线585km，广播线915km，淹没影响小水电站6座等。按照2000年下半年价格水平，匡算的丹江口水库淹没及移民安置规划静态投资约为129亿元。
综上，南水北调中线一期水源工程规划阶段静态投资为151亿元，其中丹江口大坝加高工程为22亿元，丹江口水库淹没及移民安置规划为129亿元。
2.南水北调中线一期干线工程规划投资
南水北调中线一期干线工程从丹江口水库陶岔渠首引水，沿线开挖渠道，经唐白河流域西部过长江流域和淮河流域的分水岭方城垭口，沿黄淮海平原西部边缘，在郑州以西李村穿过黄河，沿京广铁路西侧北上，可基本自流到北京、天津。南水北调中线一期干线工程采用明渠自流为主和局部管道（或箱涵）的输水方案，总干渠输水流量规模：陶岔渠首的设计流量350m3/s、加大流量420m3/s，过黄河的设计流量265m3/s、加大流量320m3/s，进河北的设计流量235m3/s、加大流量280m3/s，进北京的设计流量50m3/s、加大流量60m3/s，天津干渠渠首的设计流量50m3/s、加大流量60m3/s。规划阶段总干渠陶岔至北京团城湖全长1267km，天津干渠段长154km，总干渠工程各类交叉建筑物（河渠交叉、道路交叉、节制闸、分水闸、退水闸、隧洞等）1773座，北京段设1座泵站。规划阶段主要工程量为：土石方83194万m3，混凝土1601万m3，钢筋钢材66.7万t，PCCP长度27.79万m，永久占地18.5万亩。
按照2000年下半年价格水平，匡算的南水北调中线一期干线工程规划阶段静态投资约为700亿元。按照“谁受益，谁分摊”的原则，只为某一地区服务的工程投资由该地区承担，同时为两个或两个以上地区服务的共用工程投资由各有关地区按规划分配新增加的设计毛水量的比例分摊，有关省（直辖市）分摊南水北调中线一期干线工程投资分别为河南省91亿元、河北省266亿元、北京市190亿元、天津市153亿元。
3.南水北调中线一期汉江中下游治理工程规划投资
南水北调中线一期汉江中下游治理工程包括兴隆枢纽、部分闸站改扩建、局部航道整治和引江济汉等4项工程。兴隆枢纽是汉江中下游规划的梯级渠化中最下游一级，为低水头拦河闸坝，主要任务是改善回水河段内两岸涵闸引水及干流航运条件，正常蓄水位36.5m，上游回水段长约71km，可与上一梯级华家湾衔接。汉江中下游干流两岸有部分闸站原设计水位偏高，汉江中低水位饮水困难，需要对14座水闸和20座泵站进行改扩建，对较大的谢湾和泽口闸在闸前增设泵站。局部航道整治是为改善航道条件，加大航道整治维护力度。引江济汉工程是从长江干流沙市上游大布街处引水，经长湖北在潜江市高石碑入汉江，为汉江中下游生态、环境以及灌溉航运增加新水源，设计流量500m3/s，长约83km，进口设闸控制，沿线与河渠、道路等交叉建筑物128座。规划阶段主要工程量为：土石方11345万m3，混凝土77万m3，钢筋钢材4.9万t，淹没及永久占耕园地3.8万亩。按照2000年下半年价格水平，匡算的汉江中下游治理工程规划阶段静态投资约为69亿元。
综上，南水北调中线一期工程规划阶段主要工程量共计土石方95179万m3，混凝土及钢筋混凝土1805万m3，钢筋钢材73万t，淹没及永久占耕园地46万亩。按照2000年下半年价格水平，匡算的南水北调中线一期工程规划阶段静态投资为920亿元，其中水源工程151亿元、干线工程700亿元、汉江中下游治理工程69亿元。
（三）南水北调东、中线一期工程规划投资
按照2000年下半年价格水平，匡算的南水北调东、中线一期工程规划阶段静态投资1240亿元，其中，南水北调东线一期主体工程静态投资为320亿元（包括治污工程投资140亿元）、南水北调中线一期主体工程静态投资为920亿元。
二、南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段估算投资
南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段，估算的工程总投资包括静态投资和动态投资两部分。静态投资是指按照工程可行性研究阶段价格水平年价格估算的工程投资，动态投资是指工程建设期间因物价变化引起的价差和融资利息等。
（一）南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段静态投资
1.南水北调东线一期工程可行性研究阶段静态投资
南水北调东线一期工程可行性研究阶段静态投资，由调水工程静态投资和治污工程段静态投资两部分组成。
（1）南水北调东线一期调水工程可行性研究阶段静态投资。南水北调东线一期工程主要建设内容包括：疏浚开挖整治河道14条，新建21座泵站，更新改造4座泵站，新建东湖、双王城、大屯3座调蓄水库，实施洪泽湖和南四湖下级湖抬高蓄水位影响处理工程，实施东平湖需水影响处理工程，建设穿黄工程，建设南四湖水资源控制和水质监测工程、骆马湖水资源控制工程，建设沿线截污导流工程，实施里下河水源调整补偿工程和血吸虫病防治工程，建设调度运行管理系统等。其中，南四湖至东平湖段输水河道与航运相结合，由此增加的工程投资和调水费用以山东省为主负责筹集，不纳入南水北调东线一期工程。南水北调东线一期工程共计需完成土石方31500万m3，混凝土及钢筋混凝土430.52万m3，砌石431.58万m3，工程永久占地14.06万亩，临时占地9.05万亩，拆迁房屋166.98万m2，增加装机容量23.52万kW。
南水北调东线一期工程划分为18个单项工程、93个设计单元工程，其中截污导流工程2个单项、25个设计单元工程。由于前期工作的设计、审查进度不一致，可行性研究阶段设计单元工程投资按已审批、未审批两种情况考虑。已审批工程包括7个单项工程、22个设计单元工程，其初步设计均已经国家发展改革委批复，投资按国家发展改革委批复投资计列，但蔺家坝、韩庄、二级坝泵站贯流泵价格按进口设备价格进行调整，参照蔺家坝招标价格增加设备调差。未审批工程按照2004年第三季度价格水平估算投资。南水北调东线一期工程可行性研究阶段静态投资约为260亿元（含截污导流工程投资22.28亿元），其中江苏境内工程投资95.52亿元（含截污导流工程投资7.52亿元），山东境内工程投资164.76亿元（含截污导流工程投资14.76亿元）。
（2）南水北调东线一期治污工程可行性研究阶段静态投资。南水北调东线治污工程体系是东线工程的重要组成部分，由地方政府负责。根据《南水北调东线工程治污规划》和江苏、山东两省编制的治污控制单元实施方案，南水北调东线治污项目划分为污水处理及相关设施、工业治理、截污导流、综合治理和垃圾处理5类，共426个项目，其中山东省324个，江苏省102个，静态投资约123亿元（治污工程投资140亿元，核减了规划阶段纳入调水工程的截污导流工程投资17.25亿元）。
综上，南水北调东线一期主体工程可行性研究阶段静态投资为383亿元，其中调水工程260亿元，治污工程123亿元。
2.南水北调中线一期工程可行性研究阶段静态投资
南水北调中线一期工程可行性研究阶段静态投资，由水源工程静态投资、干线工程静态投资、汉江中下游治理工程静态投资、丹江口库区及上游水污染防治和水土保持工程静态投资和其他项目投资等5部分组成。
（1）南水北调中线一期水源工程可行性研究阶段静态投资。由丹江口大坝加高工程静态投资和丹江口水库淹没及移民安置段静态投资组成。
1）丹江口大坝加高工程可行性研究阶段静态投资。丹江口水库大坝按照最终规模加高，坝顶高程由现状的162m加高到176.6m，正常蓄水位由157m提高到170m，相应库容达到290.5亿m3，增加库容116亿m3，由年调节水库变为不完全多年调节水库。主要工程量为：土石方开挖77.31万m3，土石方回填537.15万m3，混凝土130.39万m3，钢筋钢材1.23万t，帷幕灌浆3.92万m，固结灌浆1.67万m，接缝灌浆3.89万m2，坝区工程永久占地和临时占地0.65万亩。丹江口水库大坝加高工程投资估算按《国家发展与改革委关于核定丹江口水利枢纽大坝加高工程初步设计概算的通知》（发改投资〔2005〕687号）核定投资计列，考虑水源管理工程、施工期电量损失补偿，以及库区生态修复与保护、环境监测网站建设和环保科研费等，按照2004年第三季度价格水平，估算的丹江口大坝加高工程可行性研究阶段总静态投资约为25亿元。
2）丹江口水库淹没及移民安置可行性研究阶段静态投资。丹江口水利枢纽大坝加高工程水库淹没规划搬迁人口32.83万人，房屋621.21万m2，土地面积46.2万亩，淹没涉及居民、单位的乡镇37个，工业企业160家，等级公路及机耕道路1243km，桥梁35座，码头85处，输电线路580km，电信线955km，广播电视线821km，水电站8座，抽水泵站207座等，按照2004年第三季度价格水平，估算的丹江口水库淹没及移民安置静态投资约为245亿元。
综上，南水北调中线一期水源工程可行性研究阶段静态投资为270亿元，其中大坝加高工程25亿元，水库淹没及移民安置项目245亿元。
（2）南水北调中线一期干线工程可行性研究阶段静态投资。南水北调中线一期干线工程主要包括陶岔渠首、陶岔渠首至沙河南段、沙河南至黄河南段、穿黄工程段、黄河北至漳河南段、穿漳工程段、漳河北至古运河段、古运河至北拒马河段、北京输水段、天津输水段、干线工程全线供电系统、干线工程全线通信系统、干线工程全线自动化监控系统、干线管理工程等。陶岔渠首至北拒马河段采用明渠输水方案，全断面衬砌，干线工程与交叉河流全部立交，采用隧洞、倒虹吸、渡槽等建筑物，北京段采用PCCP管和暗涵相结合的输水型式，天津干线采用暗涵输水型式，主要建筑物共计2237座，干线工程全长1432km，其中天津干线长156km。陶岔渠首设计流量为350m3/s，加大流量为420m3/s，至冀京交接断面处和天津干渠渠首设计流量为50m3/s，加大流量为60m3/s。主要工程量为：土石方开挖81522.61万m3，土石方回填28907.59万m3，建筑物混凝土2033.71万m3，渠道衬砌混凝土780万m3，钢筋钢材167.9万t，永久占地和临时占地67.57万亩。
已审批的穿黄工程、古运河至北拒马河段工程和北京输水段工程，按照发展改革委核定的概算计列；黄河北至漳河南段、漳河北至古运河段、天津输水段工程投资估算，按照发展改革委审批的单项可研投资计列；穿漳工程按照水规总院审定的初步设计概算；陶岔渠首至沙河南段、沙河南至黄河南段、干线工程全线供电系统、干线工程全线通信系统、干线工程全线自动化监控系统及水质监测系统、干线工程全线冰期输水措施费、环境监测网站和环保科研费、总干渠压煤补偿费、总干渠文物保护费用估算，按照2005年水利部水利水电规划设计总院可研报告预审意见和复核意见计列；其余未审批工程按照2004年第三季度价格水平估算投资，南水北调中线一期干线工程可行性研究阶段静态投资约为1005亿元。
（3）汉江中下游治理工程可行性研究阶段静态投资。南水北调中线一期汉江中下游治理工程包括引江济汉工程、兴隆水利枢纽工程、沿岸部分闸站改建、局部航道整治工程、汉江中下游水质保护、生态修复与保护、环境监测网站和环保科研等项目。主要工程量为：土石方开挖6650万m3，土石方填筑1645万m3，建筑物混凝土127万m3，渠道衬砌混凝土79万m3，钢筋钢材8.4万t，淹没及永久占耕园地3.8万亩。按照2005年水利部水利水电规划设计总院可研报告预审意见和复核意见计列（2004年第三季度价格水平估算），南水北调中线一期汉江中下游治理工程可行性研究阶段静态投资约为87亿元，其中水质保护、生态修复与保护、环境监测网站和环保科研等4项费用为4亿元。
（4）丹江口库区及上游水污染防治和水土保持工程静态投资。根据国务院批准的《丹江口库区及上游水污染防治和水土保持规划》，为防止社会经济发展产生新的水土流失和新的污染源，实现丹江口库区水质长期稳定达到国家地表水环境质量Ⅱ类标准要求，汉江干流省界断面水质达到Ⅱ类要求，直接汇入丹江口水库的各主要支流达到不低于Ⅲ类标准的目标。按照预防为主、保护优先，水质水量并重、点源面源同控、统筹协调、突出重点，立足近期、着眼长远，政府引导，社会参与的原则，规划进行污水处理厂、工业点源治理、小流域综合治理、垃圾清理及处理、生态农业示范工程、科学技术研究与推广、监测能力建设。南水北调中线一期工程可行性研究阶段，计入丹江口库区及上游水污染防治和水土保持工程投资70亿元。
（5）其他项目投资。南水北调中线一期工程可行性研究阶段，计列了水资源统一管理工程以及洪水影响评价、工程地质灾害评估、矿产资源占压调查、总干渠调度及控制运行研究、干线工程自动化与运行决策系统研究规划、总干渠膨胀土渠坡处理现场试验、总干渠建筑与环境规划、总干渠三维仿真信息系统、总干渠冰期输水研究、丹江口大坝加高工程金属结构检测及试验、中线工程移民管理决策支持系统、兴隆水利枢纽基础加固（搅拌桩）室内及现场试验研究、中线工程初步设计审查和整体可研报告编制等专题专项费用，计列投资3亿元。
综上，南水北调中线一期工程可行性研究阶段主要工程量共计土石方开挖88250万m3，土石方回填31090万m3，建筑物混凝土2291万m3，渠道衬砌混凝土859万m3，钢筋钢材178万t，永久占地80万亩。南水北调中线一期工程可行性研究阶段估算静态投资为1435亿元，其中水源工程270亿元，干线工程1005亿元，汉江中下游治理工程87亿元，丹江口库区及上游水污染防治和水土保持工程70亿元，其他项目3亿元。
3.南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段静态投资
按照2004年第三季度价格水平，估算的南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段静态投资为1818亿元，其中，南水北调东线一期主体工程静态投资383亿元（包括治污工程投资123亿元），南水北调中线一期主体工程静态投资1435亿元。
（二）南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段动态投资
南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段，动态投资包括工程建设期价差和银行贷款利息等。依据《水利工程设计概（估）算编制规定》，以可行性研究阶段静态投资为基础，2008年对南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段动态投资进行了测算。
1.南水北调东、中线一期工程动态投资测算的边界条件
（1）物价指数：按工程建设期物价上涨指数2.5%测算。
（2）贷款利率：按现行长期贷款基准利率6.84%测算。
（3）静态投资流程：根据2002—2008年工程实际投入，以及各设计单元工程审批计划，经综合平衡分析提出了南水北调东、中线一期工程分年度投资流程。
（4）工程静态投资估算价格水平年为2004年三季度。
（5）除规划阶段确定的中央投资372亿元和南水北调工程基金290亿元外，其他投资按使用银行贷款考虑。
2.南水北调东、中线一期工程动态投资测算结果
经测算，南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段动态投资为502亿元，其中建设期价差为210亿元，建设期贷款利息为292亿元。
南水北调东线一期工程可行性研究阶段动态投资为114亿元，其中价差39亿元，贷款利息75亿元。东线一期调水工程可行性研究阶段动态投资为82亿元（截污导流工程6亿元），其中建设期价差28亿元（截污导流工程2亿元），贷款利息54亿元（截污导流工程4亿元）；东线一期治污工程可行性研究阶段动态投资为32亿元，其中建设期价差11亿元，贷款利息21亿元。
南水北调中线一期主体工程可行性研究阶段动态投资为388亿元，其中建设期价差171亿元，贷款利息217亿元。丹江口库区及上游水污染防治和水土保持工程不计列动态投资。
（三）南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段增加的耕地占用税
2008年1月1日，《中华人民共和国耕地占用税暂行条例》（以下简称新《条例》）开始实施。按照国务院第204次常务会议精神，将南水北调工程涉及的耕地占用税列入工程概算。依据新《条例》及有关规定，按照南水北调东、中线一期工程用地数量、用地手续办理情况，以及各省市平均税额等，2008年测算了南水北调东、中线一期工程增加的耕地占用税。
1.南水北调东、中线一期工程用地情况
（1）南水北调东、中线一期工程永久占地情况。根据南水北调东、中线一期工程总体可行性研究报告，工程永久占地93.91万亩，其中东线工程13.61万亩，中线工程80.3万亩。2008年，已办用地手续永久占地8.76万亩，其中东线工程1.6万亩，中线工程7.17万亩。
（2）南水北调东、中线一期工程临时用地情况。根据南水北调东、中线一期工程总体可行性研究报告，工程临时用地50.98万亩，其中东线工程8.8万亩，中线工程42.18万亩。2008年，已办用地手续临时用地10.13万亩，其中东线工程0.23万亩，中线工程9.9万亩。
2.南水北调东、中线一期工程耕地占用税测算
根据南水北调东、中线一期工程用地的实际情况，分已办理用地手续土地和尚未办理用地手续土地两种情况进行测算。
（1）已办理用地手续土地。
1）永久占地。南水北调东、中线一期工程已办用地手续的永久占地均已根据国务院1987年公布的《中华人民共和国耕地占用税暂行条例》及有关规定，按占用耕园地面积和各省（直辖市）平均税额（湖北5.0元/m2、河南4.5元/m2、河北4.5元/m2、北京8.0元/m2、天津7.0元/m2、江苏6.0元/m2、山东4.5元/m2）缴纳了耕地占用税，已纳税额为2.19亿元，其中东线工程0.36亿元，中线工程1.83亿元。
2）临时用地。南水北调东、中线一期工程临时用地未缴纳耕地占用税。
（2）尚未办理用地手续土地。
1）永久占地。南水北调东、中线一期工程尚未办理用地手续永久用地应缴纳的耕地占用税额按农用地地类、面积，以及相应税额标准进行测算。主要测算条件如下：①根据财政部、国家税务总局于2008年2月26日公布的《中华人民共和国耕地占用税暂行条例实施细则》（简称《实施细则》）规定，各省市平均税额分别为湖北25.0元/m2、河南22.5元/m2、河北22.5元/m2、北京40.0元/m2、天津35.0元/m2、江苏30.0元/m2、山东22.5元/m2。②根据新《条例》规定，占用基本农田的适用税额在各省市平均税额的基础上提高50%，南水北调东、中线一期工程占用基本农田面积分别按占用耕园地面积之和的75%、80%测算。③根据《实施细则》规定，占用林地、牧草地、养殖水面及其他农用地从事非农业建设的，适用税额可适当低于当地占用耕地的适用税额，按各省（直辖市）平均税额计算。
经测算，南水北调东、中线一期工程尚未办理用地手续的永久占地应缴纳耕地占用税163亿元，其中东线工程23亿元、中线工程140亿元。
2）临时用地。根据新《条例》第十三条规定，“纳税人临时占用耕地，应当依照本条例的规定缴纳耕地占用税。纳税人在批准临时占用耕地的期限内恢复所占用耕地原状的，全额退还已经缴纳的占用税”。按临时用地缴纳耕地占用税考虑，测算方法与尚未办理用地手续的永久占地耕地占用税相同。
经测算，南水北调东、中线一期工程尚未办理用地手续的临时用地应缴纳耕地占用税79亿元，其中东线工程15亿元、中线工程64亿元。
（3）增加耕地占用税分析。按照上述测算结果，以及南水北调东、中线一期工程总体可研报告中已计列耕地占用税18.4亿元（均为永久占地），分析需增加耕地占用税约226亿元，其中永久占地147亿元，临时用地79亿元，临时用地耕地占用税按规定先征后返。
南水北调东线一期工程增加耕地占用税约36亿元，其中永久占地21亿元，临时用地15亿元；南水北调中线一期工程增加耕地占用税约190亿元，其中永久占地126亿元，临时用地64亿元。
（四）南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段总投资
2008年，国务院批准《南水北调东线一期工程可行性研究总报告》和《南水北调中线一期工程可行性研究总报告》，按照2004年第三季度价格水平，估算的南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段总投资为2546亿元，其中静态投资1818亿元，动态投资502亿元（其中建设期价差210亿元，贷款利息292亿元），增加耕地占用税226亿元。
国务院南水北调办负责组织实施的工程可行性研究阶段总投资为2289亿元，其中静态投资1599亿元，动态投资464亿元（其中建设期价差197亿元，贷款利息267亿元），增加耕地占用税226亿元。
地方负责实施的南水北调东线治污、截污导流工程，南水北调中线丹江口水库及上游水污染防治和水土保持工程，汉江中下游治理中水质保护、生态修复与保护、环境监测网站及环保科研项目，投资共计257亿元，其中静态投资219亿元，动态投资38亿元（其中建设期价差13亿元，贷款利息25亿元）。
（五）南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段投资增加原因分析
南水北调东、中线一期工程可行性研究阶段总投资2546亿元，与规划阶段1240亿元相比，增加了1306亿元。其中，静态投资增加578亿元（包括增列的丹江口水污染防治和水土保持工程投资70亿元），增加按年均物价上涨幅度2.5%计算的建设期价差210亿元和按银行贷款年利率6.84%计算的建设期贷款利息292亿元，以及按新《条例》执行增加的耕地占用税226亿元。
1.南水北调东线一期工程可研阶段静态投资增加的原因
南水北调东线一期调水工程可研阶段静态投资260亿元，与规划阶段静态投资180亿元相比，投资增加80亿元；治污工程可研阶段静态投资123亿元，与规划阶段静态投资140亿元相比，核减了计入调水工程的截污导流工程投资17亿元。南水北调东线一期调水工程投资增加的主要原因如下。
（1）物价和政策性因素共增加投资约51亿元。①征地补偿倍数由原来的10倍调整为16倍及耕地亩产值提高、房屋补偿单价提高，增加计列耕地开垦费、耕地占用税、森林植被恢复费等，以及实物量增加，增加投资43亿元；②规划采用2000年下半年的价格水平，总体可行性研究阶段采用2004年第三季度价格水平，增加投资3亿元；③规划阶段贯流泵机组考虑国内生产，但从已开工的项目情况看，国内生产不能满足质量要求，因此，在总体可行性研究阶段由国产全部改为进口，增加投资4亿元；④已开工项目材料设备调差增加投资1亿元。
（2）工程方案调整、工程量增加及具体工程项目变化或处理措施调整等增加投资27亿元。①胶东输水干线过济南城区段由利用小清河方案改为埋涵方案，增加投资10亿元；②鲁北段工程聊城市区段由穿城区方案调整为绕城方案，调整小运河两岸灌区影响处理工程，增加投资5亿元；③规划阶段考虑里下河水源调整工程分期建设，总体可行性研究阶段，经反复协调和分析比较后，认为规划阶段确定的工程内容不能满足向北调水的需要，需要调整工程方案，增加投资5亿元；④规划阶段截污导流工程投资是以东线工程治污规划为基础确定的，总体可行性研究阶段随着前期工作深度的变化，相应增加投资5亿元；⑤其他工程由于工程量变化增加投资2亿元。
（3）工程项目变化增加投资约2亿元。为加强省级水资源的管理，总体可行性研究阶段增加了骆马湖水资源控制工程、南四湖水资源监测工程。以及总体可行性研究阶段适当增加了血吸虫防治、文物保护等工程的投资。
2.南水北调中线一期工程可研阶段静态投资增加的原因
南水北调中线一期工程可研阶段静态投资1435亿元，与规划阶段静态投资920亿元相比，中线一期工程可研阶段静态投资增加515亿元，投资变化的主要原因如下。
（1）政策及价格性因素共增加投资约230亿元。①征地补偿倍数由原来的10倍调整为16倍及耕地亩产值提高，增加投资49亿元；②移民房屋与附属物补偿单价提高及增加移民困难户建房补助等，增加投资10亿元；③可行性研究阶段增加计列耕地开垦费、耕地占用税、森林植被恢复费等，增加投资20亿元；④规划阶段投资匡算的依据是水利部水建〔1998〕15号文而可行性研究阶段投资估算的依据是水利部水总〔2002〕116号文与计价格〔2002〕10号文。因投资估算依据的费用标准和定额变化，增加投资24亿元；⑤规划阶段汉江中下游治理工程的运行管理费用按由湖北省负责考虑。可行性研究阶段，湖北省提出其难以承担全部的运行管理费用。经协调，建议利用兴隆枢纽形成的水位差，增加电站建设内容，以利用发电效益部分解决汉江中下游治理工程的运行管理费用，增加投资4亿元；⑥规划阶段尚未要求进行工程的洪水评价。可行性研究阶段，根据修改后的《水法》要求，进行了工程的洪水影响评价，并相应采取工程措施，增加投资15亿元；⑦规划阶段没有考虑南水北调中线总干渠与河北四大水库的连接。可行性研究阶段，根据京石段应急供水工程的需要，增加总干渠与河北四大水库的连接工程，增加投资1亿元；⑧规划阶段依据国家环保局1996年批复的中线环境影响评价计列环境保护、水土保持投资。可行性研究阶段，以新的环境影响评价为依据，确定环境影响和水土保持处理措施，并按2004年物价水平估算投资，相应增加投资7亿元；⑨规划阶段初步估算了文物保护投资3亿元。可行性研究阶段，由于前期工作深度增加等原因，增加投资6亿元；⑩规划采用2000年下半年的价格水平，可行性研究阶段采用2004年第三季度价格水平，增加投资94亿元。
（2）工程量变化增加投资约150亿元。①随着设计阶段的深入，建筑物数量、型式发生了一些变化。总干渠交叉建筑物从规划阶段的1774座增加到2237座增加463座，而且增加了25座渠道倒虹吸，需要多占用水头。总干渠的总水头是一定的，其后果是明渠的可利用水头减少，因而需使明渠纵坡变缓，断面加大，增加工程量。为了渠道倒虹吸的安全，可行性研究阶段加大了建筑物的埋深，并结合洪水影响评价，适当延长了建筑物的长度，这些引起了工程量的增加；②由于线路方案比选的深入，总干渠全长从规划阶段的1421km增加到1432km，长度增加11km，渠道工程量相应增加。焦作煤矿、邢台煤矿段总干渠线路由穿过采空区改为绕开采空区方案，完善了特殊地质段的处理措施，增加膨胀土的换土厚度，天津段工程方案由规划阶段的明渠结合局部管涵方案改为全部管涵方案，相应增加了工程量。增加了冰期输水措施等内容。
（3）征地实物指标及补偿项目变化、计入丹江口水污染防治和水土保持工程投资等增加投资约135亿元。①规划阶段征地实物指标是以2001年的典型调查及1990—2001年初所做的实物调查为基础。2001年以来，随着经济社会的发展，征地实物指标有了增加，体现在总量增加和质量提高两方面。如农民住房面积和质量提高，水源工程征地有25.67万亩增加到25.75万亩，但菜地增加2万亩。由于实物指标变化增加投资约52亿元；②由于种种原因在规划阶段未考虑或漏项的项目，如总干渠压矿影响问题、陶岔渠首引水渠补偿问题、兴隆枢纽浸没影响问题等，增加投资13亿元；③按国阅〔2006〕13号文件精神，计入丹江口水污染防治和水土保持工程投资，增加投资70亿元。
三、南水北调东、中线一期工程投资总规模
截至2012年3月底，南水北调东、中线一期工程初步设计批复基本完成，其中国务院南水北调办负责组织实施的155项设计单元工程已批154项。由于国家2008年批复可行性研究总报告后，物价上涨幅度较大、征地移民政策调整，以及近些年国家宏观经济政策调整等因素，南水北调东、中线一期工程投资规模与国家批复的可研总投资相比有一定幅度增加。为保障南水北调工程建设资金需要，按照2012年3月国务院南水北调工程建委会第六次会议要求，有关部门全力配合，对初步设计阶段概算投资进行了汇总分析，测算了工程建设期动态投资，提出了南水北调东、中线一期工程投资总规模测算报告，经中国国际工程咨询公司评估，并征求有关方面意见后上报国务院。2014年，国务院批复同意南水北调东、中线一期工程增加投资测算及筹资方案，核定南水北调东、中线一期工程总投资为3082亿元。
（一）南水北调东、中线一期工程静态投资规模
南水北调东、中线一期工程静态投资，包括初步设计概算、重大设计变更、增加投资和征地移民增加投资。
1.南水北调东、中线一期工程初步设计概算
2012年，对南水北调东、中线一期工程初步设计概算投资按照已批和待批两种情况进行汇总统计，预计初步设计概算的静态投资。需要特别说明，依据《水利工程设计概（估）算编制规定》（水利部水总〔2002〕116号），工程初步设计概算价格水平年按照编制年份确定，因由南水北调东、中线一期工程特点决定没有总体初步设计，而各设计单元工程初步设计概算编制、审查和批复分别在不同年份，所以工程初步设计概算没有统一的价格水平年。
（1）已批初步设计情况。依据国家现行政策和有关规程规范，在南水北调工程初步设计审查、概算评审和审批过程中，严格控制工程投资。截至2012年3月底，已批复154个设计单元工程及相关专题专项初步设计报告，批复静态投资2133亿元。
（2）待批初步设计情况。截至2012年3月底,尚未批复初步设计的是中线水源调度运行管理系统工程和东、中线一期部分专项工程，预计待批复工程初步设计静态投资约15亿元。
（3）预计初步设计概算。国务院南水北调办负责组织实施的东、中线一期工程，预计初设概算静态投资2148亿元，其中东线工程296亿元（江苏水源工程107亿元、山东干线工程189亿元），中线工程1852亿元（中线水源工程476亿元，中线干线工程1266亿元，汉江中下游治理工程109亿元，初步设计、审查和概算评审工作经费约1亿元）。
2.南水北调东、中线一期工程重大设计变更
南水北调东、中线一期工程规模巨大，建设周期长。在工程建设期间，由于工程沿线社会、经济发展，地质条件变化，膨胀土等世界性技术难题的处理，以及工程与公路、铁路、航运等行业建设的交叉等建设条件和环境变化等原因，南水北调工程建设过程中，不可避免发生一些重大设计变更，投资增加较多，在批复的初步设计概算中难以解决。为保障南水北调工程建设投资需求，保障工程建设质量和进度，加强投资控制管理，2012年3月对已批复的重大设计变更、正在处理的重大设计变更和预计发生的重大设计变更进行统计分析，预计由国务院南水北调办批复的南水北调工程重大设计变更概算外增加投资共72亿元（包括已批复32亿元，正在处理30亿元，预计还要发生10亿元），其中东线工程8.3亿元（江苏水源工程2.8亿元、山东干线工程5.5亿元），中线工程63.7亿元（中线水源工程3.4亿元、中线干线工程60.3亿元）。
3.丹江口库区移民、中线干线征迁增加投资
南水北调工程征地移民补偿安置在实施过程中，由于移民安置方案和工程施工方案的变化或调整、实施周期过长、有关规程规范存在缺陷等原因，在大规模搬迁移民任务完成后，发生了一些新问题，超出了征地移民包干任务，无法在包干投资范围内加以解决，需要增加部分投资。主要有丹江口水库（湖北）移民在内安过程中，部分移民安置点的高切坡、高边坡等地质隐患处理工程措施费；丹江口水库移民实物指标和安置人口较初步设计阶段有所增加，需要追加相应的投资；南水北调中线干线工程取土和弃渣方案变化增加部分投资；工程施工周期客观上超出《土地法》对临时占地期限的规定，需对被占地农民增加补偿等。以上共需新增投资约22亿元，其中丹江口水库移民补偿及安置增加投资11亿元，中线干线工程征迁增加投资11亿元。
综上，核定国务院南水北调办负责组织实施的东、中线一期工程静态总投资为2242亿元，其中东线一期工程304.3亿元（江苏水源工程109.8亿元、山东干线工程194.5亿元），中线一期工程1937.7亿元（中线水源工程490.4亿元、中线干线工程1337.3亿元、汉江中下游治理工程109亿元、初步设计、审查和概算评审工作经费1亿元）。
（二）南水北调东、中线一期工程动态投资规模
南水北调东、中线一期工程动态投资包括建设期价差、建设期项目法人银行贷款利息和过渡性资金借款利息等。
1.建设期价差
南水北调东、中线一期工程建设区域分布广、建设期跨度长，各施工年度完成投资的价格水平年与批复初步设计概算时的价格水平年不同，有的相差较大，特别是工程建设后半期，物价水平尤其是建筑材料、油料、人工等价格变化幅度较大，原批复概算不能准确反映工程造价情况。为保证工程顺利建设，保障工程建设单位和施工单位的合法权益，总体把握工程投资额度，对工程建设期价差进行了测算。
（1）价差测算的基本原则。①按照各设计单元工程年度实际完成静态投资流程、国家统计局统计年鉴所发布的固定资产投资价格指数及预测指数，以初步设计批复概算价格水平年为基期进行测算；②考虑东线、中线各设计单元工程征地拆迁投资先期投入并包干使用，除特殊情况外，原则上不再计算征地拆迁投资建设期价差。
（2）价差测算结果。经测算，国务院南水北调办负责组织实施的东、中线一期工程建设期总价差为221亿元，其中，东线一期工程为21亿元（江苏水源工程8.5亿元、山东干线工程12.5亿元），中线一期工程200亿元（中线水源工程41亿元、中线干线工程145亿元、汉江中下游治理工程14亿元）。
2.建设期项目法人银行贷款利息
（1）银行贷款利息测算的基本原则。①东线工程测算至2014年6月，中线工程测算至2015年4月；②2011年年底以前采用南水北调工程各项目法人实际累计贷款和付息金额，2012年以后按预测借款流程测算；③贷款利率按当时的长期贷款基准利率7.05%测算。
（2）银行贷款利息测算结果。经测算，国务院南水北调办负责组织实施的东、中线一期工程建设期银行贷款利息支出为137亿元，其中东线一期工程为16.6亿元（江苏水源工程6.8亿元、山东干线工程9.8亿元），中线一期工程为120.4亿元（中线水源工程23.9亿元、中线干线工程96.5亿元）。
3.过渡性资金借款利息
重大水利工程建设基金是通过利用三峡基金2009年停收后的电价空间征收，国务院第204次常务会议审议同意，建设期征收资金不能满足建设需要时，先利用银行贷款（过渡性资金），之后使用2010—2019年征收的重大水利工程建设基金偿还贷款本息。
（1）过渡性资金借款利息测算的基本原则。①2012年以后重大水利工程建设基金以2011年实际征收入库量作为基数，年均增长率按4.4%测算；②过渡性资金借款利息计算至2015年4月；③2011年年底以前按实际贷款和付息额计算，2012年及以后按当年所需重大水利工程建设基金扣除当年该基金预算后测算；④贷款利率按当时的长期贷款基准利率7.05%测算；⑤过渡性借款资金利息全部通过重大水利工程建设基金支出预算安排，当年结清，不计复利。
（2）过渡性资金借款利息测算结果。经测算，南水北调东、中一期工程建设期过渡性资金借款本金900多亿元，支付利息176亿元。
综上，核定国务院南水北调办负责组织实施的东、中线一期工程动态投资534亿元，其中建设期价差221亿元、南水北调工程项目法人银行贷款利息137亿元、过渡性资金借款利息176亿元。南水北调东、中线一期工程建设期价差和南水北调工程项目法人银行贷款利息358亿元计入南水北调工程固定资产投资。其中，东线一期工程37.6亿元（江苏水源工程15.3亿元、山东干线工程22.3亿元），中线一期工程320.4亿元（中线水源工程64.9亿元、中线干线工程241.5亿元、汉江中下游治理工程14亿元）。
（三）南水北调东、中线一期工程待运行期管理维护费
南水北调东、中线一期共有155个设计单元工程，由于各设计单元工程开工建设时间有先后，建设工期有长短，必然有一批设计单元工程在全线工程建成前先期完工。为确保先期完工项目与全线工程同步正常投入运行，在待运行期内，须投入一定的人力、财力和物力，对其进行必要的管理和维修养护。
1.待运行期管理维护方案
该方案由待运行期限和待运行期项目组成。
（1）南水北调东、中线一期工程待运行期限。南水北调设计单元工程施工合同验收后，至东、中线一期主体工程通水前，为设计单元工程的待运行期。南水北调东、中线一期工程待运行期发生的费用计入主体工程建设成本。
（2）南水北调东、中线一期工程待运行期项目。根据南水北调东、中线一期工程建设进度计划，经统计东、中线一期主体工程共有123个设计单元工程需要进行待运行期管理维护。汉江中下游治理工程，以及东线影响处理和补偿性的工程等，不再考虑待运行期管理维护问题。
2.待运行期管理维护费测算
（1）待运行期管理维护费用的构成。由于对水利工程供水待运行期间的成本费用构成没有专门规定，在对有关办法规定的供水成本梳理后，结合南水北调工程实际情况，参考调研的京石段、宝应站、济平干渠等工程待运行期实际发生的费用资料，工程待运行期间管理维护费用按管理人员工资、管理费、维修养护费及其他等4项费用考虑。
（2）待运行期管理维护费用的标准。
1）管理人员数量和工资的标准。人员数量按照《水利工程管理单位定岗标准（试点）》（水办〔2004〕307号），对建筑物、河道工程做了典型分析，结合京石段、宝应站、济平干渠工程待运行期管理人员实际情况，待运行期管理人员数量按正常运行管理人员的30%考虑。
工资标准按照《南水北调东、中线一期工程运行初期供水价格政策初步安排意见》和《中国统计年鉴》发布的各省（直辖市）国有单位平均工资数据。2004—2010年采用南水北调工程沿线省（直辖市）工资标准的平均值，2011—2014年以各省（直辖市）发布的《2012年统计公报》中2011年居民消费价格指数平均值作为工资环比价格指数推算。
2）管理费用的标准。参考国家批复的南水北调东、中线一期工程可研报告，并考虑工程待运行期加强安全监测、安全保卫等项工作，确定管理费按管理人员工资的两倍计算。
3）维修养护费用的标准。按照《水利工程维修养护定额标准》，选择洪泽站为典型，计算其维修养护费用为158万元/年，占固定资产额的0.52%。根据调研的京石段、宝应站和济平干渠资料分析，待运行期年维修养护费为相应固定资产额的0.3%～0.7%。可研报告中测算工程供水成本费用时，工程正常运行的日常维护费用按固定资产额的1%计列。综上分析，按固定资产额的0.5%测算工程待运行期年度维修养护费。
4）其他费用的标准。参考国家批复的南水北调东、中线一期工程可研报告，并考虑部分直接材料费，其他费用标准按上述3项费用之和的10%计算。
（3）测算结果。按照上述确定的待运行期项目、待运行期限、管理人员数量、工资标准、管理费标准和维修养护费标准等，测算南水北调东、中线一期工程待运行期管理和维修养护费用为19亿元。
鉴于南水北调东、中线一期工程初步设计概算中计列了生产准备费4.8亿元，为了提高投资使用效益，考虑将生产准备费中的生产及管理单位提前进场费、管理用具购置费等（约3亿元），与待运行期管理维护费中的人员工资和管理费统筹使用，核定东、中线一期工程待运行期管理维护费为16亿元，其中东线5亿元（江苏水源工程3亿元、山东干线工程2亿元），中线工程11亿元（中线水源工程0.2亿元、中线干线工程10.8亿元）。
（四）南水北调中线干线工程防洪影响处理等项目投资
南水北调中线干线工程有469座左岸排水建筑物，为确保工程建设和运行期沿线城乡人民群众生命财产安全，增加中线干线防洪影响处理工程投资11.31亿元，以及中线一期工程安全风险评估费0.8亿元，并入中线一期工程总投资。同时，根据南水北调东、中线一期工程建设实际需要，增加工程政府验收费用0.49亿元。
（五）特殊预备费
南水北调工程规模大、战线长，预计全部工程建成竣工验收尚需较长的时间，工程建设过程中难免还会出现一些新情况、新问题。为解决南水北调东、中线一期工程建设期间的一些特殊不可预见事项，计列特殊预备费20亿元。
（六）核定南水北调东、中线一期工程投资总规模
2014年，国务院批复同意南水北调东、中线一期工程增加投资测算及筹资方案，核定南水北调东、中线一期工程投资总规模为3082亿元（含东线工程554亿元、中线工程2528亿元），其中国务院南水北调办负责组织实施的总投资为2814亿元，地方负责实施的南水北调东、中线一期工程投资268亿元。
国务院南水北调办负责组织实施总投资2814亿元，其中静态投资2242亿元、动态投资534亿元（包括建设期价差221亿元、建设期贷款利息313亿元）、新增项目投资18亿元（包括待运行期管理维护费16亿元、工程风险评估和政府验收等项目2亿元）、特殊预备费20亿元。
（七）南水北调东、中线一期工程总投资增加原因分析
南水北调东、中线一期工程总投资3082亿元，与可行性研究阶段2546亿元相比，增加了536亿元。其中，静态投资增加417亿元、动态投资增加70亿元、新增项目投资29亿元、特殊预备费20亿元。南水北调东、中线一期工程投资增加的主要原因如下。
1.南水北调东、中线一期工程静态投资增加417亿元
静态投资增加主要有6个方面因素。
（1）因技术方案变化增加投资39亿元。增资的主要原因：①南水北调东线引黄济青明渠段、泗洪站等工程，因线路调整、建筑物结构型式和渠道或建筑物地基处理方式改变引起投资增加；②南水北调中线干线34个设计单元工程，渠道渗控、排水方案调整及坡面防护方案变化等增加投资；③初步设计阶段公路桥梁工程采用了新标准、新规范，对公路桥结构设计要求提高，部分由等跨简支梁板桥变为不等跨连续箱梁桥及新增渗控工程等增加投资；④石太等铁路交叉工程由可研的三孔一联改为初设的三孔单独布置引起投资增加；⑤供电工程按照初设阶段复审意见，110kV以上线路设计概算需补列防舞动措施费用，召马站、董村站及内丘等35kV等线路改建方案变化引起投资增加；⑥工程设计方案调整，引起征地、搬迁人口以及水保、环保方案调整等增加投资；⑦丹江口水库（湖北）移民在内安过程中，部分移民安置点按照群众意愿依山就势建设，产生了高切坡、高边坡等地质隐患，需采取相应的工程措施以保障人民群众生命财产安全；⑧中线干线工程线路长、工程论证和实施周期长，原规划的就近取土和弃渣的方案发生了一些变化等增加了部分投资，以及工程临时占地超期需增加的补偿等。
（2）工程量变化增加投资10亿元。主要原因：①建筑物结构设计工作深化，增加河道、左排行洪断面、部分左排布置由正交改为斜交、增加进出口整流设施、渠道断面变化导致左岸排水建筑物加长等，使建筑工程量增加；②跨渠公路桥数量调整，路线及桥墩位置调整等引起的工程量增加；③初步设计阶段深化，征地面积、人口数量、占压房屋面积、专项设施迁建数量等变化引起投资增加；④丹江口水库移民实施搬迁与国务院办公厅2003年发布停建令相距近8年，实施阶段实物指标和安置人口较初步设计阶段有所增加。
（3）相关政策调整及取费标准变化增加投资116亿元。主要原因：①按照南水北调中线干线工程相关技术规定和相关文件，渠道和建筑物增加渗控、防冻胀措施，倒虹吸管身两侧用低压缩性土回填，倒虹吸进口满足淹没深度要求，部分渡槽增加排冰闸，以及渠道分缝及其材料调整，膨胀土的膨胀性判别标准改变，膨胀土程度及其换填土厚度调整等；②公路、铁路、供电工程等因行业标准变化增加投资；③征地拆迁勘测设计费由可行性研究阶段的2.5%调整为初设阶段的3%，增加部分投资；④监理费取费执行新标准引起投资增加；⑤征地拆迁基本预备费率由可行性研究阶段的12.5%～15%调整为初设阶段的10%，工程基本预备费率由可研的10%（11%）调整为初设的6%，减少了投资。
（4）价格水平年调整增加投资237亿元。主要原因:①初步设计概算价格水平年调整（与可行性研究阶段2004年第三季度价格水平相比）；②初步设计阶段，水泥、钢材、油料、砂石料等建筑材料价格上涨引起投资增加。如：中线沙河南至黄河南鲁山北段工程，初步设计概算2008年四季度价格水平，水泥324.60元/t，钢筋4166.50元/t，汽油5765.01元/t，柴油5136.71元/t；可研投资估算2004年三季度价格水平，水泥252.87元/t，钢筋3749.72元/t，汽油4594.32元/t，柴油4336.82元/t；③初步设计阶段，亩产值、临时占地复垦费、房屋机井坟墓补偿单价、专项复建单价、基础设施及场地平整单价等提高增加投资。
（5）重大设计变更增加投资72亿元。南水北调工程规模大、建设周期长，同时由于南水北调工程线路长，地形、地质条件复杂，存在很多技术难题，工程建设期间，工程沿线经济、社会发展变化较大，建设条件和环境不断发生变化，不可避免地发生一些重大设计变更，增加投资较多，在批复的初步设计概算中难以解决。根据重大设计变更处理情况，主要有丹江口大坝加高初期大坝混凝土缺陷检查与处理，中线膨胀土（岩）处理方案变化，中线焦作城区段提高安全度，中线干线高填方渠段加固措施，中线干线沿线跨渠桥梁工程数量、设计方案调整，东线苏鲁省际工程杨官屯河闸、大沙河闸设计方案调整，以及东线苏鲁两省和省际工程管理设施专项、调度运行管理专项等重大设计变更引起的概算外投资增加。
（6）耕地占用税据实计列比可行性研究阶段估算投资减少57亿元。初步设计阶段执行2008年1月1日施行的《中华人民共和国耕地占用税暂行条例》及相应的配套规定，本着从紧从严的原则计列永久和临时占地耕地占用税。按照各设计单元工程投资变化分析，初步设计阶段增加耕地占用税约169亿元，比国家批复可研总报告中暂列的增加耕地占用税226亿元减少57亿元。
2.南水北调东、中线一期工程动态投资增加70亿元
动态投资包括价差和建设期贷款利息。
（1）工程建设期价差增加24亿元。价差增加的主要原因：①南水北调工程建设目标调整，可行性研究阶段以东、中线一期工程2010年建成测算价差，建委会第三次会议将工程建设目标调整为东线2013年建成通水、中线2014年建成汛后通水；②2004年之后，工程建设期年均价格增长幅度大于可行性研究阶段测算价差采用的2.5%；③工程建设沿线人工价格和砂石料价格实际涨幅远远超出国家公布的固定资产价格指数。
（2）工程建设期贷款利息增加46亿元。贷款利息增加的主要原因：①可行性研究阶段以东、中线一期工程2010年建成测算利息，工程建设目标调整，使工程建设期延长，贷款利息相应增加；②工程总投资增加，相应增加了过渡性资金额度，引起融资利息增加；③银行贷款利率调整引起贷款利息增加。
3.新增项目投资29亿元
根据南水北调东、中线一期工程建设实际情况，经国务院南水北调工程建设委员会第六次会议审议同意，增加工程待运行其管理维护、中线干线防洪影响处理工程和其他项目等投资29亿元。
（1）先期完工项目待运行期管理维护费16亿元。南水北调东、中线一期共有155个设计单元工程，由于各设计单元工程开工建设时间有先后，建设工期有长有短，必然有一批设计单元工程在全线工程建成前先期完工。为确保先期完工项目与全线工程同步正常投入运行，在待运行期内，须投入一定的人力、财力和物力，对其进行必要的管理维护和养护。参考水利工程相应维修养护定额标准，结合南水北调东、中线一期工程实际情况测算，新增先期完工项目待运行管理维护费16亿元。
（2）中线干线防洪影响处理等项目投资13亿元。南水北调中线一期干线工程有469座左岸排水建筑物，需同步实施防洪处理影响工程，确保工程建设和运行期沿线城乡人民群众生命财产安全。中线一期工程可行性研究阶段未考虑该项工程投资。按照国家发展改革委建议意见，由水利部单独编制中线干线防洪影响处理工程可研报告，增加中线干线防洪影响处理工程投资11.31亿元。
（3）其他项目增加投资1.29亿元。其他项目包括中线工程安全风险评估费0.8亿元，并入中线一期工程总投资中；南水北调东、中线一期工程验收费0.49亿元。
4.特殊预备费20亿元
鉴于南水北调工程规模巨大，地质条件十分复杂，2012年正处于工程建设的关键时期，工程建设过程中难免还会出现一些新情况、新问题或突发事件，需要及时有效应对，同时还存在一些难以准确预测的因素。为避免再次调整南水北调工程总投资规模，经各方协商一致，计列特殊预备费20亿元。